אגף תפעול הוקם בשנת 2011 במטרה לאחד תחת מטרייה אחת את התחומים: הובלות, דואר, ביטחון, חירום, נראות ואיכות הסביבה, מינהל מדענים אורחים, דיור סטודנטים, אולמות, בתי אירוח, מסעדות, רכב, תחבורה וגינון.
עובדי אגף תפעול מעניקים שירות לכלל המחלקות המדעיות, האגפים המנהליים והדיירים במכון ויצמן למדע.
עובדי אגף תפעול רואים עצמם מחויבים להעניק ללקוחותיהם שירות אישי ואיכותי המושתת על הגינות, מהירות, יעילות, מקצועיות, כבוד ואכפתיות.
