שירותי מחשוב עתירי ביצועים | משאבי WEXAC

מחשוב מעבדים גרפיים (GPU Computing)

עולם מחשוב הביצועים הגבוהים והמחשוב המדעי משתנה ומתפתח בקצב מסחרר בשנים האחרונות.

על מנת לספק למדענים את הכלים והטכנולוגיות החדישים ביותר, קיבלנו החלטה ליישם מקבץ חישוב חדיש אשר מבוסס על טכנולוגיית GPU. טכנולוגיה זו מאפשרת שילוב כמות גדולה של ליבות עיבוד על פיסת סיליקון אחת ויחידה. בהשוואה בין שבב עיבוד לשבב GPU עדכני, ניתן לראות שמעבד יכול להכיל לכל היותר 6 ליבות, לעומת שבבי GPU שניתן לצייד בלמעלה מ-400 ליבות, וזאת על גבי פיסת סיליקון בודדת.

שימוש בטכנולוגיה מסוג זה מתאים ליישומים המדעיים הבאים:

• עבודות תחומות CPU (בהשוואה לתחומות I/O)
• אלגוריתמים שמיועדים לעיבוד מקבילי
• משימות שמצריכות זמני חישוב ארוכים יחסית

קיימים בעולם כיום מאות מוסדות אקדמיים, וביניהם אוניברסיטת הרווארד, קיימברידג', המכון הטכנולוגי של טוקיו ועוד, שהמחקר שלהם מבוסס על טכנולוגיה זו .
ברצוננו לאתר מעבדות מקומיות בעלות צרכים חישוביים המתאימים לדרישות ההרצה של מעבדי GPU, על מנת לבחון את האפשרות לשפר משמעותית את משך זמן ההרצה בעבודתן. אנו בטוחים כי טכנולוגיה זו תסייע למדענים‏ להתמודד עם מגוון האתגרים החישוביים שניצבים בפניהם כיום.

MUMmerGPU: יישור רצף DNA בקצב תעבורה גבוה באמצעות מעבדים גרפיים

האצת HMMR באמצעות אינפורמטיקת מעבדים גרפיים ברת הרחבה

להלן קישורים למידע רלוונטי באתר יצרנית המעבדים הגרפיים Nvidia:

Data Center

Bioinformatics and Life Sciences

Computational Chemistry